PAKファイル

WAD が8文字の名前を1つのレベル内で使っていたのに対し、PAK は maps/e1m1.bsp や sound/weapons/rocket1.wav のようなフルパスを保存した。形式は呆れるほど単純で、ヘッダ PACK、ディレクトリのオフセットとサイズ、続いて1エントリあたり64バイト（名前56、オフセット4、長さ4）が並ぶ。圧縮は一切ない。

エンジンはまずファイルシステムを探し、次に PAK ファイルを番号の大きい順に探した。MOD は pak2.pak を元ファイルの横に置くだけでよかった。1999年の Quake III は、名前を変えただけの ZIP である PK3 に切り替え、あらゆるアーカイバを一瞬で MOD ツールに変えた。