Bioinformática
La informática aplicada a las secuencias biológicas: comparación de cadenas donde las cadenas resultan ser ADN.
El término lo acuñaron en 1970 los investigadores neerlandeses Paulien Hogeweg y Ben Hesper, mucho antes de que hubiera genomas que analizar. El campo estalló con el Proyecto Genoma Humano (terminado en 2003) y con máquinas de secuenciación que pasaron de costar miles de millones por genoma a unos pocos cientos de dólares. Lo que surgió fue un problema informático: petabytes de fragmentos de texto cortos que hay que volver a encajar.
El instrumental es llamativamente anticuado y basado en texto. FASTA y FASTQ son formatos de texto por líneas, BAM es el equivalente binario comprimido, y BLAST (1990) sigue siendo la herramienta estándar para encontrar secuencias parecidas: en el fondo, búsqueda aproximada de cadenas con heurística. Python con Biopython y pandas domina el análisis, R la estadística, y el cómputo corre en clústeres o GPU.