X11R3
A versão do X de outubro de 1988 em que o toolkit Xt tomou a forma sobre a qual o Motif e o Athena seriam construídos.
A R3 saiu em 25 de outubro de 1988, poucos meses depois da R2, mas com muito mais coisa dentro. A grande mudança estava no X Toolkit Intrinsics: o estado global das primeiras versões deu lugar a um contexto de aplicação explícito, e a interface foi congelada com firmeza suficiente para que os fabricantes ousassem construir seus próprios conjuntos de widgets por cima. Foi a base sobre a qual a OSF logo assentaria o Motif.
A fita contrib tinha inchado bastante, trazendo gerenciadores de janelas, jogos e experimentos, incluindo trabalhos iniciais do que viria a ser o GWM. O que ainda faltava eram as regras de convivência entre clientes e gerenciadores de janelas; a ICCCM circulava como rascunho e só ficou pronta na R4. Nesse meio-tempo, cada gerenciador interpretava a situação à sua maneira, o que explica boa parte do comportamento criativo da época.