Bioinformatyka
Informatyka stosowana do sekwencji biologicznych — dopasowywanie ciągów znaków, które akurat są DNA.
Termin ukuli w 1970 roku holenderscy badacze Paulien Hogeweg i Ben Hesper, na długo zanim istniały genomy do analizy. Dziedzina eksplodowała wraz z Projektem poznania ludzkiego genomu (ukończonym w 2003 roku) i sekwenatorami, których koszt na genom spadł z miliardów dolarów do kilkuset. Wyłonił się z tego problem obliczeniowy: petabajty krótkich fragmentów tekstu, które trzeba złożyć z powrotem.
Zestaw narzędzi jest zaskakująco staroświecki i tekstowy. FASTA i FASTQ to formaty liniowe, BAM to ich skompresowany odpowiednik binarny, a BLAST (1990) wciąż jest standardowym narzędziem do szukania podobnych sekwencji — w istocie przybliżone wyszukiwanie ciągów z heurystykami. Analizie króluje Python z Biopythonem i pandas, statystyce R, a obliczenia idą na klastrach lub GPU.