SciPy

NumPy aporta el array; SciPy aporta los algoritmos. Submódulos: optimize (minimización, ajuste de curvas, búsqueda de raíces), signal (filtros, convolución), stats (distribuciones, contraste de hipótesis), linalg (álgebra lineal ampliada), sparse (matrices dispersas y algoritmos de grafos), integrate, fft, spatial (árboles KD, envolventes convexas). La mayor parte es una capa fina sobre código de Fortran y C ya probado —LAPACK, BLAS, ODEPACK, QUADPACK—, que es precisamente la idea: rutinas numéricas de cincuenta años con una API decente. Da nombre a todo el ecosistema SciPy, que incluye pandas, scikit-learn y Matplotlib.